MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT14

Total Repeats: 367

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017209	AAC	2	6	35	40	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183636
2	NC_017209	CAA	2	6	57	62	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183636
3	NC_017209	AAC	2	6	202	207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183636
4	NC_017209	TTA	2	6	449	454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183636
5	NC_017209	TTC	2	6	463	468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183636
6	NC_017209	TTC	2	6	482	487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183636
7	NC_017209	AGAAAC	2	12	517	528	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384183636
8	NC_017209	ATC	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183636
9	NC_017209	ATT	2	6	640	645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183636
10	NC_017209	TCT	2	6	845	850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183636
11	NC_017209	AGCA	2	8	862	869	50 %	0 %	25 %	25 %	384183636
12	NC_017209	GGA	2	6	980	985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183636
13	NC_017209	AAT	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183636
14	NC_017209	T	7	7	1059	1065	0 %	100 %	0 %	0 %	384183636
15	NC_017209	CCA	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183636
16	NC_017209	TAAACC	2	12	1188	1199	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384183636
17	NC_017209	TA	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	384183636
18	NC_017209	ACAA	2	8	1373	1380	75 %	0 %	0 %	25 %	384183636
19	NC_017209	TAC	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183636
20	NC_017209	TAA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183636
21	NC_017209	CTT	2	6	1414	1419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183636
22	NC_017209	TAC	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183637
23	NC_017209	CAA	2	6	1447	1452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183637
24	NC_017209	TTC	2	6	1482	1487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
25	NC_017209	T	6	6	1527	1532	0 %	100 %	0 %	0 %	384183637
26	NC_017209	TCCC	2	8	1539	1546	0 %	25 %	0 %	75 %	384183637
27	NC_017209	TTTTCC	2	12	1591	1602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
28	NC_017209	TTC	2	6	1779	1784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
29	NC_017209	TCTT	2	8	1801	1808	0 %	75 %	0 %	25 %	384183637
30	NC_017209	TCT	3	9	1813	1821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
31	NC_017209	TTATCT	2	12	1828	1839	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384183637
32	NC_017209	GGT	2	6	1894	1899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183637
33	NC_017209	TTGT	2	8	1929	1936	0 %	75 %	25 %	0 %	384183637
34	NC_017209	GTT	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183637
35	NC_017209	GAA	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183637
36	NC_017209	TCA	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183637
37	NC_017209	CTT	2	6	2204	2209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
38	NC_017209	ACC	2	6	2226	2231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183637
39	NC_017209	CCA	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183637
40	NC_017209	GGT	2	6	2245	2250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183637
41	NC_017209	TTA	2	6	2251	2256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183637
42	NC_017209	TCT	2	6	2257	2262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
43	NC_017209	TTC	2	6	2268	2273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
44	NC_017209	TAT	2	6	2336	2341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183637
45	NC_017209	TGG	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183637
46	NC_017209	ATA	2	6	2388	2393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183637
47	NC_017209	AT	3	6	2498	2503	50 %	50 %	0 %	0 %	384183637
48	NC_017209	T	7	7	2548	2554	0 %	100 %	0 %	0 %	384183637
49	NC_017209	AAC	2	6	2637	2642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183637
50	NC_017209	CAT	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183637
51	NC_017209	ACC	2	6	2682	2687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183637
52	NC_017209	TAC	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183637
53	NC_017209	TAA	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183637
54	NC_017209	AC	3	6	2788	2793	50 %	0 %	0 %	50 %	384183637
55	NC_017209	ATT	2	6	2800	2805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183637
56	NC_017209	TCCT	2	8	2825	2832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017209	TTA	2	6	2849	2854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017209	TTA	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017209	CTT	2	6	2893	2898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017209	ATT	2	6	2914	2919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017209	TGA	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017209	TCC	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017209	TAAT	2	8	3098	3105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017209	ATC	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017209	CAAA	2	8	3161	3168	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017209	CAT	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017209	CCA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183639
68	NC_017209	AATA	2	8	3324	3331	75 %	25 %	0 %	0 %	384183639
69	NC_017209	TTC	2	6	3379	3384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183639
70	NC_017209	GGT	2	6	3429	3434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017209	CAT	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017209	A	6	6	3504	3509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017209	CAT	2	6	3516	3521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017209	TCAT	2	8	3538	3545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017209	TAA	2	6	3623	3628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017209	ATC	2	6	3648	3653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017209	CAA	2	6	3688	3693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017209	TAGCAA	2	12	3697	3708	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017209	TATC	2	8	3834	3841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017209	CATT	3	12	3874	3885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017209	CATT	2	8	3888	3895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017209	T	7	7	3894	3900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017209	TAA	2	6	4019	4024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183640
84	NC_017209	ATC	2	6	4032	4037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183640
85	NC_017209	T	6	6	4055	4060	0 %	100 %	0 %	0 %	384183640
86	NC_017209	T	6	6	4131	4136	0 %	100 %	0 %	0 %	384183640
87	NC_017209	AAT	2	6	4164	4169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183640
88	NC_017209	CATT	2	8	4232	4239	25 %	50 %	0 %	25 %	384183640
89	NC_017209	A	8	8	4271	4278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017209	A	8	8	4302	4309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017209	T	7	7	4315	4321	0 %	100 %	0 %	0 %	384183641
92	NC_017209	TCC	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183641
93	NC_017209	GAA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183641
94	NC_017209	CTTC	2	8	4375	4382	0 %	50 %	0 %	50 %	384183641
95	NC_017209	AT	3	6	4395	4400	50 %	50 %	0 %	0 %	384183641
96	NC_017209	TAATTT	2	12	4423	4434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183641
97	NC_017209	T	7	7	4432	4438	0 %	100 %	0 %	0 %	384183641
98	NC_017209	ATT	2	6	4467	4472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183641
99	NC_017209	ACTA	2	8	4530	4537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017209	TAAA	2	8	4538	4545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017209	A	7	7	4543	4549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017209	ACA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017209	TTA	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017209	TATTT	2	10	4603	4612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017209	T	6	6	4610	4615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017209	TAC	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183642
107	NC_017209	TCA	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183642
108	NC_017209	TAA	2	6	4733	4738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
109	NC_017209	TAA	2	6	4743	4748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
110	NC_017209	T	7	7	4799	4805	0 %	100 %	0 %	0 %	384183642
111	NC_017209	AAT	2	6	4818	4823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
112	NC_017209	CCA	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183642
113	NC_017209	AATT	2	8	4835	4842	50 %	50 %	0 %	0 %	384183642
114	NC_017209	TAAA	2	8	4859	4866	75 %	25 %	0 %	0 %	384183642
115	NC_017209	TC	3	6	5007	5012	0 %	50 %	0 %	50 %	384183642
116	NC_017209	CA	3	6	5075	5080	50 %	0 %	0 %	50 %	384183642
117	NC_017209	ATA	2	6	5156	5161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
118	NC_017209	TAA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
119	NC_017209	AAT	2	6	5271	5276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
120	NC_017209	TTA	2	6	5277	5282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183642
121	NC_017209	TTA	2	6	5289	5294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183642
122	NC_017209	GTC	2	6	5340	5345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183642
123	NC_017209	CTTT	2	8	5365	5372	0 %	75 %	0 %	25 %	384183642
124	NC_017209	CAT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183642
125	NC_017209	TCC	2	6	5431	5436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183642
126	NC_017209	TTTCTT	2	12	5486	5497	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384183642
127	NC_017209	T	7	7	5569	5575	0 %	100 %	0 %	0 %	384183642
128	NC_017209	AT	3	6	5664	5669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017209	A	6	6	5690	5695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017209	T	9	9	5798	5806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017209	CATA	2	8	5836	5843	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017209	AAAG	2	8	5882	5889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017209	A	9	9	5923	5931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017209	AAAT	2	8	5966	5973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017209	TCT	2	6	6020	6025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017209	T	6	6	6041	6046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017209	CCA	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017209	T	6	6	6095	6100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017209	T	7	7	6106	6112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017209	A	7	7	6125	6131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017209	TAA	2	6	6282	6287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017209	T	7	7	6291	6297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_017209	TAA	2	6	11014	11019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183651
283	NC_017209	TAA	2	6	11046	11051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183651
284	NC_017209	TCA	2	6	11118	11123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183651
285	NC_017209	CAAA	2	8	11251	11258	75 %	0 %	0 %	25 %	384183651
286	NC_017209	GATAAT	2	12	11354	11365	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183652
287	NC_017209	CTT	3	9	11475	11483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183652
288	NC_017209	AT	3	6	11495	11500	50 %	50 %	0 %	0 %	384183652
289	NC_017209	TGT	2	6	11549	11554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183652
290	NC_017209	T	6	6	11578	11583	0 %	100 %	0 %	0 %	384183652
291	NC_017209	TCGTT	2	10	11613	11622	0 %	60 %	20 %	20 %	384183652
292	NC_017209	CTT	3	9	11628	11636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183652
293	NC_017209	ATT	2	6	11686	11691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183653
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295	NC_017209	AAT	2	6	11711	11716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183653
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297	NC_017209	TTC	2	6	11751	11756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183653
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301	NC_017209	CTT	2	6	11977	11982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183653
302	NC_017209	TAA	2	6	11986	11991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183653
303	NC_017209	GTTTT	2	10	12031	12040	0 %	80 %	20 %	0 %	384183653
304	NC_017209	CGTT	2	8	12068	12075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
305	NC_017209	T	6	6	12074	12079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_017209	TA	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017209	TAAT	2	8	12150	12157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_017209	ATTTT	2	10	12186	12195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_017209	AT	3	6	12204	12209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_017209	AAAC	2	8	12237	12244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
311	NC_017209	ATT	2	6	12282	12287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_017209	AAATCA	2	12	12318	12329	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
313	NC_017209	AAT	2	6	12337	12342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_017209	TAG	2	6	14848	14853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.